マクロス ゼロ

1999年、南太平洋のアタリア島に巨大な隕石が落下した。調査の結果、宇宙には人類史上最大の強敵となりうる高等生物が存在する可能性が判明し、各国政府は国家間の利害関係を凍結し、統合軍を設立。世界の現存国家を単一の人類政府に統合し、コードネームASS-1と呼ばれるこの異星人の宇宙船の再建を開始した。 しかし、ちょうどこの時、ソ連を中心とするワルシャワ条約機構は、各国の文化的差異を重視すべきと主張し、この同盟に反対。反統合軍同盟を結成し、西側諸国が主導する統合軍に対抗した。2000年から2007年にかけて、双方は異星人の遺跡と技術を入手するため、世界各地で激しい争奪戦を繰り広げた。後世では（第一次）統合戦争と呼ばれる。 2008年、統合戦争は一段落し、反統合軍勢力もほぼ制圧された。南太平洋のマヤ島に異星人の遺跡が発見されたとの報を受け、統合軍は回収のため特別任務艦隊を派遣した。しかし、同じ情報を得た反統合軍同盟の残存勢力も、この重要な技術を統合軍より先に回収し、現在の劣勢を挽回しようと特別任務艦隊を送り込んだ。両者はこの太平洋の小島を巡り、激しい海空の戦いを展開する。 この時、主人公の工藤シンは統合軍戦闘機パイロットとして、この戦いに身を投じる。