碇シンジ

本故事的主角，14岁，操纵EVA初号机的第三适格者（THIRD CHILDREN）。 NERV司令碇源堂的独子。母亲死后，他就住在亲戚家中，和碇源堂分居了十年，突然接到父亲的信而来到第三新东京都市。有着极端内向的性格，极其害怕与陌生人接触，不知如何和别人相处而感到害怕，一直只是照着别人的要求而生活，之后慢慢地敞開了心扉。 作为驾驶员的他与EVA初号机的同步值最高，在歼灭使徒的各次战役中的表现亦最为突出。但其本人性格内向、处事态度消极、遇事总是用“对不起”来逃避现实成为明日香对其最为反感的原因。