「亜人」と呼ばれる不死の神秘的な人間が、最初に発見されたのは17年前のアフリカであった。その発見以来、彼らは悪意を持って能力を行使する可能性があり、かつ絶滅させることが不可能であるとして、人類に対する脅威と見なされるようになった。それ以来、社会内で亜人が発見され次第、直ちに逮捕・拘束されることとなっている。
医師を目指して勉強に励む高校生の永井圭は、亜人についてほとんど知識がなく、たまにニュースで目にする程度だった。学校では亜人は人間とは見なされないと教えられているが、圭は授業にほとんど注意を払っていない。そのため、この分野に関する彼の危ういほどの理解は、死ぬはずの事故を生き延びたことで完全に無意味なものとなる。それは彼が亜人として再生したこと、そして苦難の日々の始まりを告げるものだった。しかし、全世界から追われる孤独な逃亡生活の中で、圭はやがて、自分と同じ種族が思っていたよりはるかに近くに存在していることに気付く。
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