针对神秘异形入侵者“Neuroi”的新一轮攻势准备正稳步推进。此次作战目标是夺回卡尔斯兰帝国首都柏林，此举对将Neuroi势力彻底驱逐出欧洲至关重要。然而，敌军具备每日适应战场环境的能力，仅凭现有盟军战力与 Striker 技术恐难以取胜。 与此同时，扶桑出身的魔女宫藤芳佳正在洛桑继续医学研修。经历先前丧失魔力的变故后，她已逐渐恢复，并渴望为战事贡献力量。征召令很快传来，第501统合战斗航空团的魔女们将再度集结，为这场终极决战挺身而出。