地球被神秘外星生命体"奇居子"摧毁后，人类残存者乘坐巨大的世代飞船"希德尼亚"逃往宇宙。在太空中漂流了数千年后，希德尼亚时隔百年再度遭受奇居子的袭击。 面临种族灭绝的危机，凭借人类与奇居子的混合体白羽衣䌷以及王牌卫人驾驶员谷风长道的力量，人类勉强取得了暂时的胜利。 十年后……希德尼亚的居民们享受着短暂的安宁。和平的日子里，䌷逐渐意识到自己对已成为希德尼亚英雄的长道怀有的感情。然而，正如小林舰长始终深知的那样——只要奇居子依然存在，和平便无法长久。 最终决战的决定已经下达：这场战役将决定人类最后幸存者的命运。当终结临近之时，船员们能否守护他们所爱之人？