随着比鲁萨鲁多纳米金属都市的溃败，人类的毁灭似乎已成定局。更糟的是，队长晴夫榊因拒绝牺牲人性而遭到残余比鲁萨鲁多部队的猛烈抨击，他们将战败归咎于他。在至暗时刻，少数幸存者转而信奉埃克西夫教派，该教派宣称虔诚信仰是从哥斯拉手中获得救赎的唯一途径。 然而，埃克西夫教徒并非表面所见那般单纯。随着幸存者们的信仰日益狂热，榊开始怀疑祭司梅特菲斯究竟隐藏着什么秘密——尤其是他与被称为基多拉的怪物之间究竟存在何种关联。