故事发生在日本。时值2030年，一种名为“吉比亚”的病毒肆虐全球，感染者会依据年龄、性别和种族变异成形态各异的怪物，地球已彻底沦陷。 一位武士与一名忍者自江户时代初期穿越时空，抵达满目疮痍的日本，协助致力于研发病毒解药的教授。 为拯救人类，他们踏上征途，与无数吉比亚怪物、不法之徒及其他凶恶强敌展开殊死搏斗。