最上瞬太热爱战斗之魂卡牌游戏。一日，他被战斗之魂卡牌中迸发的光芒传送至一切战斗之魂的起源——魂界。在那里，他遇见了一位名叫绘图的少女，她声称是自己将瞬太召唤至魂界，目的是为了阻止复活的邪神皇毁灭这个世界——这位邪神皇曾企图摧毁魂界，最终被击败并封印。来自异世界、手持绿色卡组且充满自信的约库·阿尔巴特罗萨也加入了瞬太的行列。两人一同踏上旅程，寻找最初封印邪神皇的十二位神皇。