影片聚焦于少女ANEMONE，七年前她在东京战役中失去了父亲，仅剩毛绒玩具Gulliver与人工智能礼宾Dominikids作为情感寄托。如今她成为实验部队"AcID"战略部署的关键一环，旨在对抗已造成26亿人死亡的宿敌——第七代优莱卡"Eureka Seven"。被逼至绝境的全人类将希望寄托于ANEMONE，她将深入Eureka Seven的内部核心展开决战。