公元2071年。随着名为“荒神”的食人怪物出现,人类被逼至灭绝边缘。这些怪物对常规武器具有免疫力,它们肆虐大地,吞噬途经的一切,所过之处只余虚无。为对抗荒神,组织“芬里尔”应运而生,作为拯救人类的最后希望——他们启用“神机使”,即体内融合了奥拉细胞的特殊人类,能够操纵唯一已知可击杀荒神的武器“神机”。少年空木莲华正是其中一员,身为新型神机使的他,所持神机兼具剑与枪两种形态。
如今,作为芬里尔最强大的武器之一,莲华必须精通神机操控,方能实现彻底消灭荒神的夙愿。怪物仍在不断大量涌现,残存的人类在漫漫长夜中挣扎求生。唯有神机使,屹立于荒神与人类种族彻底灭亡之间。