世界闻名的怪盗鲁邦三世及其搭档次元大介，成功从摩纳哥国营赌场的金库中盗走一笔钜款，并甩开追兵乘车逃走。两人在车内虽然可说是被埋在钞票堆里，但眼尖的鲁邦却发现，这是史上制作最精巧的梦幻伪钞“哥德钞”。在鲁邦“不偷假货”的原则下，他将哥德钞毫不吝惜地撒在路上，并选定了他的下一个目标就是要揭开哥德钞的秘密。于是鲁邦出发前往疑云重重的欧洲独立国家“卡里奥斯特罗公国”。
鲁邦与次元两人改变身份潜入卡里奥斯特罗公国，但车子却在路上爆胎。在修轮胎时，他们发现一名身穿结婚礼服的少女被恶汉所追，于是出手击退恶汉，救了坠崖的少女。但留下了一枚刻有哥德文字戒指的少女，却被另一群人给带走。之后证实，那名少女正是卡里奥斯特罗公国大公家的继承人克蕾莉丝‧德‧卡里奥斯特罗。目前由于现任大公猝逝，由莱瑟‧德‧卡里奥斯特罗伯爵担任摄政，留下大公之位的空缺。而鲁邦也想起了自己在初出茅庐时期，与年幼的克蕾莉丝之间曾有过一面之缘。
身为卡里奥斯特罗公国实质统治者的莱瑟，打算借由娶克蕾莉丝为妻取得大公之位，进行独裁统治。再度成为阶下囚的克蕾莉丝，被关进了莱瑟的居城卡里奥斯特罗城。鲁邦为了将她救出，找来了老战友石川五右卫门。但得知鲁邦对莱瑟发下预告书的钱形警部，也率领了警官队（埼玉县警察局的机动队）前来，准备逮捕鲁邦。加上早已变装为家庭教师潜入卡里奥斯特罗城的峰不二子在内，“鲁邦家族”至此全数到齐了。以卡里奥斯特罗城为舞台，为了救出克蕾莉丝与揭开哥德钞之谜，展开了一场大混战。
