《苹果核战记：阿尔法》的故事设定于另一条时间线，虽由系列前作导演执导，却未延续先前电影的世界观，而是以平行起源的形式展开。布里亚留斯此时已改造为生化人，并未经历与迪娜分离后又于奥林匹斯重逢并加入ESWAT的过往。
本作描绘22世纪迪娜·纳特与布里亚留斯的早期经历：二人穿越反乌托邦化的纽约废墟，踏上寻找奥林匹斯城的旅程。受废墟都市军阀双角雇佣，他们奉命清除双足战斗机械。战斗中，二人邂逅了执行任务的伊里斯与奥尔森，并结为盟友共同行动。
伊里斯肩负着阻止邪恶生化人塔罗斯夺取人类秘密武器的使命。塔罗斯却利用伊里斯激活了巨型战争机器。
