高校生でゲーマーの水銀リクは、エリートや富裕層の子女が通う名門・神陵学園に通っている。しかし、裕福や金持ちという言葉は水銀には当てはまらない。むしろ彼は貧乏で、学費を払うためにいくつものアルバイトを掛け持ちしなければならない。ある日のアルバイト中、飼い猫を助けるためにプールに飛び込んだが、彼は泳げないことを自覚していた。幸い、ゲーム開発者の美しく人気のある娘、玲リクに救われ、彼は彼女に恋をする。 彼はまた別の少女にも惹かれていた。彼のお気に入りのオンラインRPG『ダンジョン・センチュリー』で出会った新しい友人だ。しかし、そのゲームがサービス終了を控えていると知り、彼女との冒険もすぐに終わってしまうことを悟る。ところが、ゲームが終了した翌日、玲とそのオンライン上の少女が同一人物であることを知る。その後まもなく、玲は水銀に『ダンジョン・センチュリー』に代わる新作ゲームを手渡す。墓荒らしゲーム『グレイブ・バスター』だ。しかし、玲が突然誘拐されると、水銀は彼女を救うために『グレイブ・バスター』の中へと引きずり込まれてしまう。 『銀の墓守り』は、水銀が玲を救うために『グレイブ・バスター』をプレイし、ゲームに隠された秘密を暴いていく姿を描く。