『シュタインズ・ゲート』の事件から数か月後、岡部倫太郎たちは、アメリカで開催される雷ネットバトルイベントに参加する知人・フェイリス・にゃんにゃんに同行する。そこで彼らは旧知の仲間、牧瀬紅莉栖と再会する。紅莉栖は、他の世界線で起きた出来事の断片的な記憶を夢として思い出し始めていた。彼女は岡部に、特に二人の間で起きた出来事を含むそれらの記憶が、果たして現実だったのかと問い詰める。