13歳以上の人類を死に至らしめる謎のウイルスの出現により、人類はそれまで潜伏していた吸血鬼たちに奴隷として支配されることとなった。彼らは生存者を保護するという名目で社会を支配し、その見返りとして血の提供を要求した。 生存者の中には、百夜優一郎と百夜ミカエラという二人の少年がいた。彼らは孤児院から、家族同然の他の子供たちと共に捕らえられていた。吸血鬼の残酷な支配下で家畜同然の扱いを受けることに不満を抱いたミカエラは、反逆的な脱走計画を企てるが、それは結局失敗に終わる。その結果生き残ったのは優一郎だけであった。彼は日本の吸血鬼殲滅に特化した軍事部隊「月鬼ノ組」に発見され、保護される。 それから数年後、日本帝鬼軍の一員となった優一郎は、家族を惨殺した吸血鬼への復讐を誓う。しかし、その代償はあまりにも大きいものだった。