高貴なるカッパ王国がラッコ帝国に滅ぼされた後、カッパの王子ケッピは力を失い、不可視のカッザンビたちに無力となる。これらのゾンビは世界を蝕み、ラッコたちが生み出した、人々の深層欲望の顕現であった。やむなくケッピは三人の少年に頼るほかない。行くところどこへでも箱を携える矢逆一稀、彼の幼なじみ・陣内燕太、そして非行に走り不登校の久慈悠。彼らは神秘の臓器・尻子玉を抜かれることで、自らもカッパとなり、カッザンビと戦う力を得る。しかしゾンビを倒すためには、少年たちは互いの心と体、そして何より秘密で結ばれねばならない。カッパ王国の命運を担う三人は、これまで誰にも明かさなかった己を曝け出し、繋がりというものがいかに脆く、そして尊いものかを学んでいく。