ある静かで平和な日、空が裂け、異次元存在「アンノウン」が人類に対して迅速かつ残忍な攻撃を開始した。国の未来を守るため、日本のすべての子供たちは戦争が終結するまで危害から遠ざけるべく冷凍睡眠に付けられた。 数年後、人類は日本の一角に前線基地を確立。もはや絶滅の危機に直面していないことから、子供たちは眠りから覚めさせられる。その時、冷凍睡眠中に子供たちがそれぞれ固有の超常能力「ワールド」を発現させていたことが判明する。最も強力な六人の子供たちは奪還された都市の指揮権を与えられ、その能力を使って継続する侵攻から要塞を防衛することとなった。幼なじみの朱雀壱弥と宇多良カナリアは東京を、千種霞と千種明日葉の姉弟は千葉を、天花寺姫と輪堂ホタルは神奈川を統括する。 やがて、アンノウンによるほぼ日常化した攻撃と、都市の長および副長たちの衝突する性格が些細な確執を生み、三都市間には絶え間ない論争が持ち上がる。アンノウンが突然、攻撃の圧力を増大させる中、三都市のリーダーたちは互いに協力する術を学ばなければ、人類絶滅に対する最後の防衛線を失う危険に直面する。