交通事故による3年間の昏睡状態から覚め、涼宮遙はついに欅総合病院を退院した。愛する家族と献身的な恋人・鳴海孝之の温もりに支えられ、彼女はゆっくりと外界に順応していく。孝之は、遙の入院中に交際していた恋人と別れ、かつての愛を再び追い求める道を選んだのだった。 しかし、孝之の負担になることを恐れた遙は、彼と別れることを提案し、去り行く電車の中に彼を置き去りにする。絵本作家としての道を志す決意を新たにした遙は、大学入学試験に向けて勉強に没頭する。一方、続く不況の中、孝之は安定した職を得ようと奮闘する。一見異なる目標を追い求める二人だが、果たして最終的に再会を果たすことはできるのか？ [Written by MAL Rewrite]