大胆な救出作戦の末に独房へと投獄された空条徐倫は、その正体を知らぬ敵スタンド「ホワイトスネイク」とその使い手の陰謀を暴かんと戦う。 ホワイトスネイクの使い手は、グリーン・ドルフィン・ストリート刑務所の教誨師、エンリコ・プッチ神父であった。プッチはかつてジョースター家を苦しめたある悪党と深い因縁を持ち、徐倫とその父・承太郎との戦いは私怨にも等しい。亡き友の遺した計画を実行に移すため、プッチは刑務所と囚人たちを利用し、悪辣な企みを進めていく。 エルメェス・コステロやフー・ファイターズといった囚人仲間の助けを得て、徐倫は幾人もの敵スタンド使いと戦う。やがてプッチの陰謀が刑務所の外へと広がり、世界そのものを脅かし始めた時、徐倫は自らの血統に目覚め、命を賭けて邪悪を断ち切ろうとする。