1939年、ゲルマニアが隣国に侵攻した後、ヨーロッパは壊滅的な戦争の渦に巻き込まれた。戦争中、ゲルマニアは弱小アルプス国・エイルシュタットに狙いを定める。圧倒的に優れた軍事力を持ち、戦争初期に多大な成功を収めていたゲルマニアは、エイルシュタットを容易に征服できると見られていた。 小国にとって事態がさらに悪化したのは、オルトフィネ・"フィーネ"・フレデリカ・フォン・エイルシュタット王女が、ブリタニアとの重要な会談に向かう途中、ゲルマニア兵に捕らえられた時だった。しかし、同時進行していたゲルマニアの輸送任務が失敗に終わり、生き残りの最後の魔女・イゼッタが脱出する。幼少期に覚えていたフィーネ王女の姿を認めたイゼッタは、魔法の力を用いて彼女をゲルマニア兵から救出する。こうして王女と再会したイゼッタは、エイルシュタットをゲルマニアから守ることを誓う。最後の魔女を味方に得たエイルシュタットは、帝国主義的な戦争の巨人に対し、戦局の逆転を望むのであった。