穂村千夏は、高校生活を「可愛い女の子」を演じることを目標に始める。スター選手であったにもかかわらずバレーボール部を辞め、最も繊細で女性的な楽器だと信じて、学校で評価の低い吹奏楽部に入部しフルートを吹くことにした。9年ぶりに、千夏は幼なじみで正反対の性格を持つ上条春太と再会する。残念なことに、春太は千夏がより愛らしくなろうとする努力を見抜いてしまった。しかし、千夏はめげず、吹奏楽部の指導員・草壁信二郎に恋心を抱く――しかし、春太もまた同じ思いを抱いていた！ しかし、千夏の高校生活はなかなか計画通りには進まない。彼女と友人たちの周りで、次々と謎が現れ始めるのだ。部員たちは、音楽コンクールに出場するための部員集めに奔走しながらも、学校を悩ませる謎を解き明かすために協力しなければならない。