忠実なコンピュータウイルス対策プログラムであるデュアルとドロシーは、「知恵の箱」内に構築された仮想世界の異常を監視し、常にスキャンし続けている。ウイルスが検出されると、それらは——多くの場合、世界そのものもろとも——強制的に消去される。この日課は変化なく毎日繰り返されていたが、特に大規模なウイルス群の削除により、機能の記憶を持たない「レモ」と名乗る未知のプログラムが現れる。彼女はデュアルとドロシーの単調な生活に新たな視点をもたらし、その影響で二人のプログラムは、使命以外にも人生にはもっと多くのものがあることに気付き始める。 もはや世界を見守ることだけに時間を費やさず、三人の少女はそれらを真に体験し始める。デジタル再現された都市や風景を探索しながら、デュアルとドロシーは自分たちが持つものに対する特別な感謝の念を育んでいく。それは、レモの忘れられた目的に関する手がかりを探し求める日々の中で。