非道な運命に抗い果てた衛宮切嗣に代わり、人類を救う責務を託された衛宮士郎。世界は滅びへと向かい、刻一刻と迫る終焉。しかし、士郎が求める救済の代償が、残された唯一の肉親である妹の命だとしたら――彼はなおもこの責務を全うする覚悟ができるのか？ 正義の味方であり続けるか、それとも自らが倒すと誓った悪そのものとなるか。士郎は今、重大な選択を迫られている。孤児となった彼は再び独りぼっちだが、その体は依然として剣でできている。第五次聖杯戦争は、雪の下で交わされた彼の誓いと共に、今、幕を開ける。