京極大次郎は、京都の和菓子店「甘正堂」の15代目当主。ある日、大次郎は店の地下室で「ドアマイガーD」という巨大ロボットを発見する。同時に、京都には「メカ怪獣」と呼ばれる敵が現れ、街を壊し始める。