最近のアクマ襲撃にもかかわらず、新たな本部への移転作業に意気込む黒の教団。しかし、到着早々、アレン・ウォーカーは中央庁に突然呼び出され、教団によって強制的に腕を封印されてしまう。その後、驚くべきことに師であるクロス・マリアン将軍との対面を果たし、謎に包まれた“14番目”のノアを巡る衝撃の秘密を明かされる。 怪盗事件、謎のエクソシスト集団の到来、大切な戦友の死、そしてノアの一族との全面戦争――これらはアレンや神田ユウ、教団に何をもたらすのか？一見無関係に思えるこれら不可思議な事件の連鎖は、やがてより巨大な何かへと繋がっていく。すべては、その始まりに過ぎない。