ある朝、鈴木タワーの展望台で、一人の男性が謎の狙撃手に撃たれる。たまたま事件発生時に訪れていた江戸川コナンはすぐに追跡を開始するが、狙撃手を捕らえることはできなかった。その後、彼はこの事件の容疑者ティモシー・ハンターが海軍特殊部隊の元メンバーであり、すでに別の殺人事件で調査を受けていたことを知る。FBIは、ティモシーには少なくとも三人の標的がいることを突き止める。しかし、そのうち二人が相次いで殺害された後、ティモシー自身も殺害され、調査は行き詰まる。 唯一の手がかりが途絶えたことで、連続狙撃事件のニュースは東京中に広がり、街全体がパニックに陥る。コナンは街を覆う狙撃の恐怖を終わらせるため、真犯人を見つけ出し、法の裁きに導かねばならない。 [原作：MAL Rewrite]