大切な仲間の突然の去就により、チーム・ブラックアウトの未来は不透明なものとなった。近導ユウユと大倉メグミは、避けられない結末を防げなかった無力さに苛立ちを覚え、一方で深く関与した江端トウヤは、この不幸を招いた過去の過ちを償おうと必死になっている。しかし、次にどんな道を選ぶにせよ、チーム・ブラックアウトの面々は、かけがえのないカードゲーム『カードファイト!! ヴァンガード』を通じて、必ずまた一つになれることを知っていた。