バトラーたち――それは千年の歴史とある運命を背負った守護者たち。 ジェイは妹のテンナ、そして相棒のバトラー・ハヤカワと平和に暮らしていた。 しかし、その平穏な日々は突然終わりを告げる。 テンナは虚無に飲み込まれ、ジェイは百年後の未来へと飛ばされてしまった。 ジェイの屋敷があった場所には今、コヨミ学園という学院が建っていた。 ジェイは神宮司黄萬と名を変え、学園の生徒会長となり、過去の手がかりを探る。 やがてジェイは、この世界の真相を知ることになる。