物語は1969年の日本で繰り広げられる。主人公の浅葱まりんは孤児で、彼女を拾ってくれたお婆さんと長屋に住む人々と共に暮らしている。貧しい生活の中でいじめられても、彼女は決して挫けず、懸命に生きようとしていた。 　　ある日、異世界から来た生体兵器がまりんを突然襲撃する。逃げ惑うまりんは、ロロの助けを借りて神社で宝瓶を手に取り、誤ってその中に封印されていた異世界の生体兵器、主人公のメラン・ブルーを目覚めさせてしまう。　メランは武術に長け、まりんを守ろうとする仲間も現れるが、激しい攻撃は巻き添えを生み、まりんは騒動の張本人と見なされ、人々から孤立し排斥されてしまう。一方、裏切り者と認定されたメランもかつての仲間から追われる身となる。最後に排斥された二人の行く末はどうなるのか？そして、全ての事端の真の黒幕は誰なのか？