ヨルンは空に浮かぶ二つの巨大な都市を見上げ、その謎を解き明かすことを夢見ていた。しかし突然、その謎が彼を訪ねてくる。エデンの刺客たちが彼の父を殺害し、ヨルンは次の標的となる。名もなき老人と謎の少女の助けを借りて、ヨルンは長く行方知れぬ母と真実を求める旅に出る。ゴッドハンターと呼ばれるヨルンは、技術を支配する者たちの暗い企てとの戦いを率いていく。