父の突然の転勤により、一人暮らしを余儀なくされた高校一年生・里見孝太郎。家賃月五千円という破格の条件で、コーロナハウス106号室への入居を即決した。最初は順調だったが、アルバイト先で偶然見つけた謎の洞窟をきっかけに、彼の生活は一変する。 その夜、孝太郎のもとには、次々と「部屋の主」を名乗る異能の少女たちが押し寄せた。部屋に棲みつくという幽霊・東本願早苗、魔法少女・ユリカ、異星の王女・シア・フォルトーゼ、そして地底民の末裔・クラノ・キリハ。彼女たちはそれぞれの事情でこの部屋を必要としており、決して引く気はない！ 『六畳間の侵略者！？』は、超常的存在たちによる六畳一間の騒動と、笑いと恋の学園生活、そして何かと世話を焼く大家さんを描く、コメディバトルロワイヤルである。 [Written by MAL Rewrite]