物語は今からそう遠くない近未来、人類が軌道エレベーターを完成させ、本格的に外惑星開発に乗り出した時代。謎の宇宙生命体「オブリクウス」が太陽系に狙いを定め、人類は初めて遭遇した異星人との戦争状態に突入する。 圧倒的な技術力を持つ敵に対抗するため、クロノス財団は日本の宮本武蔵や坂本龍馬からフランスのナポレオンやジャンヌ・ダルクまで、各国の英雄たちの末裔を集結。彼らに生体兵器「ギア」戦闘服を融合させた特殊兵器「クロノスギア」を誕生させた。