『薄桜鬼 碧血録』の物語は、『薄桜鬼』の終結後、雪村千鶴と新選組が京都を離れ、江戸へと船出するところから始まる。局長・近藤勇の不在の中、副長・土方歳三が局長代行として指揮を執る。しかし土方は、増大した指揮官としての責務に苦悩するだけでなく、新たに芽生えた制御不能な「渇血」の衝動とも闘っていた。周囲の者たちが心配するほどに。さらに事態を悪化させるように、その衝動は彼だけに留まらず、部下たちの中にも狂気を誘い始めていた。 そんな中、近藤が帰還し、帝から城を守護せよとの命と、新たな隊名「甲陽鎮撫隊」を与えられる。しかし戦場では、力の均衡は突然崩れ、忠誠心も揺らぐものだ。『薄桜鬼 碧血録』では、千鶴が新選組と共に戦乱の核心へと足を踏み入れ、行方知れぬ父を探し続ける。そして、土方との絆は、次第に強く深いものになっていく。 [Written by MAL Rewrite]