巨大な怪虫の脅威が江戸の地を襲っていた。その虫はあまりにも強力で、一般人では手に負えず、虫奉行と呼ばれる特殊な秘術や戦闘スタイルを極めた戦士たちによって狩られることとなる。彼らはその戦力を強化するため、津軽藩の剣豪・月島源十郎を招集する。 しかし、ある不幸な事件により、源十郎はその招集に応じることができず、代わりに息子の仁兵衛を送り込む。自らの臆病さが招いた事件の罪を償おうと決意した仁兵衛は、江戸へ赴き虫奉行に加わることを承諾する。燃えるような闘志と揺るぎない決意を武器に、仁兵衛はより強い侍となり、江戸から虫の脅威を一掃することを誓う。 [Written by MAL Rewrite]