シリーズ開始時点で、ピーター・パーカーがスパイダーマンになってから1年が経過している。彼は悪を懲らしめ正義のために戦っているが、まだスーパーヒーローとしての道を学び続けている。S.H.I.E.L.D.のニック・フューリーは、ピーター・パーカーに真のスーパーヒーローとなる訓練の機会を与え、アルティメット・スパイダーマンへと導く。 『アルティメット・スパイダーマン』は、ブライアン・ベンディス、ポール・ディニ、およびマン・オブ・アクション（スティーブン・T・シーグル、ジョー・ケリー、ジョー・ケイシー、ダンカン・ルーローからなるチーム）によるマーベル・コミックのキャラクターを基にしたアメリカンアニメシリーズである。本作はアルティメット・スパイダーマンコミックをベースとしており、他のマーベル・スーパーヒーローキャラクターもゲスト出演する。