元気でスリルを求める小学六年生、突破バシンが心に決めていることはただ一つ――カードゲーム「バトルスピリッツ」のことだ。行方不明の父から受け継いだルビーのペンダントを身に着けたバシンは、毎日学校へ向かうのを心躍らせている。勉強のためではなく、カードバトルのためだ。それはクラスメイトたちを当惑させるほどだった。 ある日、バシンは同じようなペンダントを身に着けた、バトルスピリッツの天才児チャンピオン・Jと出会う。憧れを抱いたバシンはJにバトルを挑む。しかし、そこで待ち受けていたのは予想もしなかった戦いだった。二人は突如、空に浮かぶ謎の闘技場――異界世界（イセカイワールド）へと転送され、ゲームのスピリッツが現実のものとなる。 ついに夢が手の届くところに来たと感じたバシンは、異界世界に真っ先に飛び込み、同じく特別なペンダントを持つ他のカードバトラーたちと出会っていく。頂点を目指して進む中で、バシンはバトルスピリッツにこれまで想像もしていなかった深い秘密があることに、ゆっくりと気付いていく。 [Written by MAL Rewrite]