相田マナは先生の信頼のもと、大貝第一中学校の生徒会長に就任した。社会科の課外活動で、彼女はクラスメイトと共にランドマークである四つ葉タワー（クローバータワー）を見学に訪れ、一行の世話に追われていた。ようやく展望台で友人と並んで景色を楽しむことができたその時、巨大な怪物「ジコチュー」が突然現れ、大混乱を引き起こした。傷つけられることを受け入れられないマナは、トランプ王国の精シャルルと出会い、不思議な飾りのエネルギーによって、プリキュア――キュアハートに変身する。その後、幼なじみの六花や小学生時代の遊び仲間のありすもプリキュアに加わり、「愛」を失った怪物たちを徹底的に浄化することを誓う。