これは人とポケモンが仲良く暮らす世界。マサラタウン出身のサトシは、ポケモンマスターを目指して修行の旅に出た。ある日、サトシとピカチュウはたくさんのポケモンが住む森を訪れる。突然、サトシとピカチュウは暗闇の世界に飲み込まれてしまう！その暗闇の奥から現れた「ギャラクティック・ダークロード」が、森のポケモンを奪い始めた！サトシとピカチュウは、ポケモンを救うために立ち上がり戦うことを決意する。星空に包まれた巨大なポケモンワールドをどうぞ最後までお楽しみください！