遥（綾瀬はるか 声）は普通の高校生で、幼い頃に母親（戸田菜穂 声）を亡くし、父親（大森南朋 声）に育てられた。 物語は武蔵野にある神社から始まる。幼い頃よく遊んだ神社を訪れた遥は、偶然、狐が捨てられた古いおもちゃの飛行機をこっそり運んでいるのを目撃する。狐を追って森に入った遥は道に迷い、狐の姿も見失ってしまう。突然、彼女は神秘的な気配を放つ水たまりを発見し、手を伸ばした瞬間、不思議な世界「ホッタラケの島」へと吸い込まれる。その島は、人間に捨てられたものであふれていた。 遥は先ほどの狐と再会する。その名はテオ（沢城みゆき 声）で、島の住人だった。遥はこの不思議な世界に好奇心を抱き、そこでかつて自分が大切にしていた子羊のぬいぐるみを拾う。それを見て、遥は幼い頃の自分にとって最も大切な宝物を思い出す。「そうだ、小さい頃、母がくれた手鏡があったけど、なくしてしまった。もしかしてこの島にあるのかな？」テオは不本意ながらも、遥と共に失われた鏡を探すことにする。 しかし、この島は人間が立ち入ることを許されていない。遥とテオは他の住人に気付かれないよう慎重に行動するが、「男爵」にその存在を察知されてしまう。遥は無事に手鏡を見つけられるのか？そして、現実世界に戻ることはできるのか？