体力がなさすぎて走れない？いつも物忘れがひどい！実は人間の悩みは自分自身が原因ではなく、悩み星人が作り出しているのかもしれない！幸い、IQ500の女娃博士が勇気とハッピーエネルギーで『超迷你戦士』を創造し、人類が悩みを打ち倒すのを助けてくれる！大決戦で一時的に憎き悩み星人を撃退したものの、さらに強力な新たな悩み星人が現れた。彼は決して間違えず、完璧極まりないと言われている！その一方で、女娃博士は新たな挑戦に直面する。赤い髪をした、傲慢で地上最強の小学生が現れたのだ！勢い込んで現れた彼は、果たして敵か味方か？次々と湧き上がる悩みと挑戦に直面し、迷你勇と迷你萌は困難に立ち向かいながら、自らを進化させ続け、人類のために戦い続ける！悩みがある？急いで超迷你戦士を呼び出し、あなたの悩みを打ち倒そう！