両儀式、黒桐幹也、蒼崎橙子は、近くで爆発を目撃した後、爆弾犯の調査を開始する。その夜、式は爆弾犯の姿を一瞥し、彼は彼女に執着するようになる。彼女を仕留めるため、狂人は空の駐車場に彼女をおびき寄せようと猫とネズミのゲームを仕掛ける。そして爆弾だけが彼の武器ではない：彼は未来を見る能力も持ち合わせており、式に終止符を打つことを企んでいる。 一方、数日前の別の場所では、礼園女学院の生徒、瀬尾静音が夏休みに帰省しようとしていた。しかし、バスを降りる際、彼女は近くの見知らぬ人物の死に関する未来のビジョンを見る。その人物を警告しようとする中、彼女は幹也と出会う——幹也は静音の情報を効果的に活用することに成功する。 その後、ある従業員が雇い主の10歳の娘を連れて仕事に向かう。しかし、彼の調査対象は、二人の過去からの亡霊であることが判明する。 『未来福音』は、『空の境界』本編のタイムラインに沿った物語と、未来を舞台にした一編を描く。