西暦2030年、獣のポッドが流星のように空から降り注ぎ、地球中に散らばった。これらは、邪悪な闇の天使とその配下である天界の君主たちによって滅ぼされた故郷から逃れてきた、異世界の魔法生物「ルーンビースト」であった。世界中の子供たちはこれらの獣のポッドを手にし、中に宿るルーンビーストと異次元で融合し、互いにバトルを繰り広げられることを発見する。主人公のリン・チーリーは、自身のルーンビースト「炎風龍」との強固なパートナーシップを築き、トップファイターの一人となっていく。