西暦2142年、『원더풀 데이즈』は環境汚染によってほぼ破壊された世界を描く。我々が知る人類の生活はほぼ絶滅し、地球の生態系の崩壊を生き延びられた者はわずかだった。この混沌に対処するため、「エコバン」という都市が建設された。この都市は、災害を引き起こした汚染そのものをエネルギー源として利用している。 しかし、当初の計画はある程度成功したものの、新たなエネルギー源を生み出しただけでなく、一部のエリート層も生み出してしまった。この特権的な一派は、自分たちはシステムの上に立つ存在だと信じ、労働者として働かせるのでなければ、都市の外部からの生存者を受け入れることを望まない。 エコバンの外の荒廃地に住む人々の中に、シュアという青年がいる。彼は非常に困難な生活を送っているが、幼なじみのジェイへの想いを通じて、可能な限り生き抜こうとしている。不幸なことに、ジェイはシュアよりも、警備隊長のケイドに興味があるようで、こうして三角関係が生まれる。シュアは失恋に対処しなければならないだけでなく、かつて美しかった地球の残骸の中、新たな生き残りの道を見出さねばならない。