物語は、女子高生が不可解な死を遂げる連続事件から始まる。深陽学園2年C組の女子生徒・宮下藤花は、実はブギーポップという第二人格を隠しており、その行動は奇妙である。果たして宮下はこれらの死亡事件の黒幕なのだろうか？ 　　ブギーポップ・ファントムは、都市伝説の死神なのか、それとも正義の使者なのか？