天下統一を巡る戦国時代が終結し、豊臣軍が勝利を収めた。豊臣はライバルである徳川の命を許すが、その最終決戦以来、邪悪な妖・夜叉が徳川にこう告げる――歴史が語るところによれば、天下を治めるのは豊臣ではなく、徳川であるはずだと。徳川は夜叉が差し出す妖の力に与し、この異なる現在へと繋がる鍵であるかぐや姫を殺害し、日本を支配せんとする。それを阻止できる唯一の人物が、剣技と銃撃を融合させた「ガン道」を極める、若き豪傑・宮本ムサシである。