物語は、天帝アマテラスが雷帝オース・スーパーに化身し、究加太陽星団のアトライへ赴き、親友であるクロム・バランシェ博士の最後のファティマ発表会に参加。そこで彼を深く愛するラキシスを連れ去るまでの経緯を描く…… 本作はまさに『ファイブスター物語』漫画シリーズの第1話「運命の三女神－ラキシス」を映画化したものである。