潔世一は、高校サッカー部を全国大会へ導く決勝点を目前にしながら、一瞬の判断でチームメイトにパスを送ったことで、その栄光を逃してしまった。苦く、混乱し、失望の中、潔はあの時パスを出さなければ結果は変わっていたのかと自問する。若きストライカーが家に戻ると、日本サッカー連盟からの招待状が待っていた。恣意的で偏った選考プロセスを経て、潔は「ブルーロック」という名の物議を醸すプロジェクトに選ばれたU-18ストライカー300名のうちの一人となった。 このプロジェクトの最終目標は、選ばれた選手の中から一人を、日本代表のエースストライカーへと育て上げることである。最高の参加者を見極めるため、各原石たちは、ソロ及びチーム対抗戦を勝ち抜き、頂点を目指して競い合わなければならない。プロジェクトへの倫理的疑問は脇に置き、潔はたとえ299人の野心溢れる若きストライカーの夢を冷酷に打ち砕くことになろうとも、頂点へ這い上がるために戦うことを決意する。