科学省では、熱心なお茶の水博士とその同僚たちが、人間の心を持った最初のロボット・アトムの再起動に尽力していた。アトムは、謎に包まれた天馬午太郎博士が、亡き息子・飛雄に代わるものとして作り上げた傑作である。しかし、天馬博士は不可解にも自らの創造物を停止させ、姿を消してしまう。お茶の水博士は、そんな科学の大いなる進歩を無駄にすることは断じて許さなかった。 9歳の少年の外見を持つアトムは、驚異的な強さと知性を備えているだけでなく、人間に匹敵する優れた良心と慈愛の心も授かっていた。しかし悲しいことに、機械の少年はすぐに拒絶に直面し、お茶の水博士のように歓迎してくれる者ばかりではないことを知る。自律機械は社会に組み込まれているものの、それらは単なる道具としてしか受け入れられておらず、やがては人類の支配権を脅かす存在とさえ見なされていた。 人間とロボットが共に繁栄できる世界を夢見て、アトムは両者の命を守り、真の絆を結ぶことを人々に促すために、自らの存在を捧げるのだった。 [Written by MAL Rewrite]