選ばれし5人の子供たちは、古代の島にたどり着く。そこには二種類のデジモン、獣型と人型が住んでいた。彼らは、一匹の獣型デジモンと一体の人型デジモンが友情を育んでいるのを目撃する。長く続く二種族の確執を前に、子供たちは行動を起こすことを決意する。