タカトとギルモンは沖縄へ休暇に出かけ、テイマーの仲間・ミナミと出会う。日本では、人気のコンピュータペットが突然ウイルス化し、それをインストールした全てのコンピュータに感染する。ウイルスが拡大する中、タカトはなぜデジモンたちが新たな友人を襲うのか、そして彼女とウイルスの関係を解き明かそうとする。